东北亚研究院作为一个专注于东北亚地区研究的研究机构，通常会在一些知名高校设立。以下是一些在中国和东北亚其他国家设立东北亚研究院的知名高校：
中国高校
- 北京大学 - 北京大学东北亚研究所是中国最早从事东北亚研究的学术机构之一。
- 复旦大学 - 复旦大学东北亚研究中心致力于东北亚区域的政治、经济、历史和文化研究。
- 吉林大学 - 吉林大学东北亚研究院以其在东北亚问题研究上的深厚背景和丰富资源而闻名。
- 东北师范大学 - 东北师范大学东北亚研究院专注于东北亚地区的教育、历史和社会问题研究。
- 上海社会科学院 - 上海社会科学院东北亚研究中心是一个综合性的研究机构，涉及多个学科领域。
东北亚其他国家高校
- 韩国高丽大学 - 高丽大学东北亚研究中心是韩国研究东北亚问题的主要学术机构之一。
- 日本京都大学 - 京都大学东北亚研究中心在东亚研究方面享有盛誉。
- 俄罗斯远东联邦大学 - 远东联邦大学东北亚研究中心专注于俄罗斯远东地区与东北亚其他国家的关系研究。
这些研究院通常会组织学术研讨会、出版学术期刊、开展国际合作项目等，以推动东北亚地区的研究与发展。通过这些机构，学者们可以深入探讨东北亚地区的政治、经济、安全、文化等多个领域的议题。